本科擁有專屬的內視鏡治療中心及超音波室，為中部海線地區鄉民提供最快速、最正確之親切診斷及治療。在醫療作業中，現已擁有累計上萬例之一般胃鏡及上腹部超音波、大腸鏡等豐富經驗。
內視鏡檢查
包括一般傳統的胃十二指腸鏡、 直腸鏡、大腸鏡檢查；及最新NBI, 螢光及放大內視鏡觀察。 NBI(Narrow Banding Image)是利用光線變頻使波長窄化，可突顯食道、胃、大腸表層粘膜微血管(Enhance Capillary Network)及粘膜微細腺口形態構造(Enhance Mucosal pit pattern)的原理，藉以早期辨識粘膜表層最早期癌病變， 使咽喉、食道、食道胃交接部、胃及大腸早期癌無所遁形。
體檢部亦提供無痛鏡檢 (包括無痛胃鏡，無痛大腸鏡等)，以減輕病人的不適
治療性內視鏡
在治療性內視鏡術方面，準確診斷瘜肉癌病變及內視鏡瘜肉切除術，嘉惠了多數消化道疾病患友免於開刀之苦。對於肝硬化合併食道大出血的病患，可立即實施食道靜脈結紮術、潰瘍血管止血術等，成效良好。
膽道結石的壺腹乳頭切開術及膽石摘除術等。 食道內置膺管的放置以解決末期食道癌的進食問題，及膽管內管置放以解決惡性腫瘤造成的黃疸
肝癌治療
包括 酒精肝癌注射治療
最近更引進治療肝癌新利器-無線電射頻燒灼術(RFA)，治療無法手術或不願手術之老年病患，以期獲得更好的醫療品質。
為發展成為服務及學術兼顧的次專科，本科逐步研發並引進各種新式的診斷及治療技術，致力鑽研肝病之臨床與藥物運用，此外，更深入社區進行衛教宣導及篩檢，更加強落實服務社區的理念。
本科提供在肝臟及消化道疾病方面之最新治療：肝—肝硬化、腹水、黃疸、肝昏迷、食道靜脈瘤大出血；慢性B型肝炎—肝安能、肝適能治療；慢性C型肝炎長效型干擾素合併Ribavirin治療，有約七成治癒率。消化道疾病—上下消化道出血及合併腫瘤之診斷治療。
